Εργαστήριο Περιβαλλοντικής Μικροβιολογίας και Ιολογίας

Γενικές Πληροφορίες

 

Το Εργαστήριο Περιβαλλοντικής Μικροβιολογίας και Ιολογίας-ΕΠΜΙ ιδρύθηκε το 2023 (ΑΔΑ ίδρυσης: 6ΝΠΨ469Β7Ξ-Φ3Μ). Το εργαστήριο εξυπηρετεί ερευνητικές και εκπαιδευτικές ανάγκες στα γνωστικά αντικείμενα της Περιβαλλοντικής Μικροβιολογίας και Ιολογίας περιβάλλοντος, με ιδιαίτερη έμφαση στους τομείς της Μοριακής Περιβαλλοντικής Μικροβιολογίας και Ιολογίας και της Μικροβιακής Οικολογίας και Μικροβιολογίας εδάφους.

Υποστηριζόμενα Μαθήματα ΠΠΣ

  • Βιολογία
  • Γενική Μικροβιολογία
  • Περιβαλλοντική Μικροβιολογία
  • Υγεία Εδάφους
  • Οικολογία Νόσων
  • Οικοτοξικολογία
  • Σύγχρονες Μέθοδοι Παρακολούθησης Περιβαλλοντικής Ρύπανσης

Ερευνητικά ενδιαφέροντα

 

Τα ερευνητικά ενδιαφέροντα του εργαστηρίου εστιάζουν σε δύο κύριους τομείς :

  • Μοριακή Περιβαλλοντική Μικροβιολογία και Περιβαλλοντική Ιολογία: Μελέτη της αλληλεπίδραση μικροοργανισμών και ξενιστών στα διάφορα περιβάλλοντα, μοριακή οικολογία μικροβίων και ιών, ανάπτυξη καινοτόμων μεθόδων μελέτης μικροοργανισμών, μοριακή ανίχνευση και χαρακτηρισμός μικροβίων και ιών σε βιολογικά υλικά και περιβαλλοντικά δείγματα, εργαστηριακή διερεύνηση παραγόντων εξέλιξης μικροβίων και ιών που επηρεάζουν την δημόσια υγεία και την υγεία των οικοσυστημάτων.
  • Μικροβιακή Οικολογία και Μικροβιολογία εδάφους: Μικροβιακή οικολογία εδάφους, επίδραση περιβαλλοντικών ρύπων στη σύσταση και τη λειτουργία της εδαφικής μικροβιακής κοινότητας, έλεγχος μικροβιακών δραστηριοτήτων που επηρεάζουν τις γεωχημικές διεργασίες – βιογεωχημικούς κύκλους και την εκπομπή αερίων του θερμοκηπίου, μελέτη της περιβαλλοντικής τύχης και της συμπεριφοράς αγροχημικών και λοιπών ξενοβιοτικών ουσιών.

 

Προσωπικό

 

1.   Μέλη ΔΕΠ

 

Ζαχαρούλα Κυριακοπούλου: Καθηγήτρια Περιβαλλοντικής και Μοριακής Ιολογίας (Διευθύντρια Εργαστηρίου)

 

Ευαγγελία Παπαδοπούλου: Επίκουρη Καθηγήτρια Περιβαλλοντικής Μικροβιολογίας

 

2.   Μεταδιδακτορικοί Ερευνητές

Dr. Chiara Perruchon, Περιβαλλοντική Μικροβιολογία και Βιοτεχνολογία

 

3.   Υποψήφιοι Διδάκτορες

Μαρία Κολοβού

Δημήτρης Δαλκίδης

 

4.   Μεταπτυχιακοί Φοιτητές

Δέσποινα Παπανικολάου

 

 

Επικοινωνία

 

Τμήμα Περιβάλλοντος, Κτήριο Βιοεπιστημών (ισόγειο), Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας, Συγκρότημα Γαιόπολις, Περιφερειακή Οδός Λάρισα – Τρικάλων, ΤΚ. 41500, Λάρισα.

Τηλ.: 2410-684613

e-mail: zahkyr@uth.gr

Photo Gallery

Δημοσιεύσεις

Δημοσιεύσεις κατά την περίοδο 2020-2025

 

  1. Dhakar, K., Kellari, L. M., Karas, P. A., Theodorakopoulos, A., Styllas, M. N., Papadopoulou, E., Karpouzas, D. G., Papadopoulou, K. K., Vasileiadis, S., Papadopoulou, K. K. (2024). Microbiome analysis of the lithophytic resurrection plant Ramonda heldreichii reveals root-driven tight-rhizosphere vs elevation-specific loose-rhizosphere communities. Rhizosphere, 32, 100969. https://doi.org/10.1016/j.rhisph.2024.100969
  2. Papadopoulou, E. S., * Bachtsevani, E., Katsoula, A., Charami, C., Lampronikou, E., Vasileiadis, S., Karpouzas, D. G. (2024). Nitrification inhibitors impose distinct effects on comammox bacteria and canonical ammonia oxidizers under high N fertilization regimes. Applied Soil Ecology, 199, 105417. https://doi.org/1016/j.apsoil.2024.105417
  3. Kolovou M., Panagiotou D., Süße L., Loiseleur O., Williams S., Karpouzas D.G., Papadopoulou E.S.* (2023). Assessing the activity of different plant-derived molecules and potential biological nitrification inhibitors on a range of soil ammonia- and nitrite-oxidizing strains. Appl Environ Microbiol., 89(11): e0138023. https://doi.org/10.1128/aem.01380-23
  4. Zygouras I., Leventakou D., Pouliakis A., Panagiotou S., Tsakogiannis D., Konstantopoulos G., Logotheti E., Samaras M., Kyriakopoulou Z., Beloukas A., Pateras I.S., Delides A., Psyrri A., Panayiotides I.G., Yiangou M., Kottaridi C. (2023). Human Papillomavirus 16 DNA Methylation Patterns and Investigation of Integration Status in Head and Neck Cancer Cases. Int J Mol Sci., 24(19), 14593. https://doi.org/10.3390/ijms241914593
  5. Τsakogiannis, D., Nikolaidis, M., Zagouri, F., Zografos, E., Kottaridi, C., Kyriakopoulou, Z., Tzioga, L., Markoulatos, P., Amoutzias, G. D., Bletsa, G. (2023). Mutation Profile of HPV16 L1 and L2 Genes in Different Geographic Areas. Viruses, 15(1), 141. https://doi.org/10.3390/v15010141
  6. Papadopoulou E.S.,* Bachtsevani E., Papazlatani C.V., Rousidou C., Brouziotis A., Lampronikou E., Tsiknia M., Vasileiadis S., Ipsilantis I., Menkissoglu-Spiroudi U., Ehaliotis C., Philippot L., Nicol G.W., Karpouzas D.G. (2022). The Effects of Quinone Imine, a New Potent Nitrification Inhibitor, Dicyandiamide, and Nitrapyrin on Target and Off-Target Soil Microbiota. Microbiol Spectr 10:e02403-21. https://doi.org/10.1128/spectrum.02403-21
  7. Bachtsevani, E., Papazlatani C.V., Rousidou C., Lampronikou E., Menkissolgou-Spiroudi, U., Nicol, G.W., Karpouzas, D.G., Papadopoulou E.S.* (2021). Effects of the nitrification inhibitor 3,4‑dimethylpyrazole phosphate (DMPP) on the activity and diversity of the soil microbial community under contrasting soil pH. Biology and Fertility of Soils 57: 1117–1135. https://doi.org/10.1007/s00374-021-01602-z

 

 

Διδακτορικές Διατριβές

 

Μαρία Κολοβού: In vitro και in situ αξιολόγηση της επίδρασης καθιερωμένων στη γεωργική πρακτική αγροχημικών στους νιτροποιητικούς μικροοργανισμούς του εδάφους. Επιβλέπουσα: Παπαδοπούλου Ε.

 

Δημήτρης Δαλκίδης: Μελέτη του εύρους και του μηχανισμού δράσης συνθετικών και βιολογικών παρεμποδιστών νιτροποίησης στους νιτροποιητικούς μικροοργανισμούς. Επιβλέπουσα: Παπαδοπούλου Ε.

 

 Ερευνητικά Προγράμματα

Ερευνητικά Προγράμματα κατά την περίοδο 2020-2025

 

  1. Industrial project, “Investigation of Nitrification Inhibitors Activity on Soil Ammonia- and Nitrite-Oxidizing Isolates” (Part II). Διάρκεια: 2024- 2025. Φορέας Χρηματοδότησης: Syngenta Crop Protection AG, Basel, Switzerland (Συντονίστρια: Παπαδοπούλου Ε.)
  2. Industrial project, “Investigation of Nitrification Inhibitors Activity on Soil Ammonia- and Nitrite-Oxidizing Isolates” (Part I). Διάρκεια: 2022-2023. Φορέας Χρηματοδότησης: Syngenta Crop Protection AG, Basel, Switzerland (Συντονίστρια: Παπαδοπούλου Ε.)
  3. Πρόγραμμα με χρηματοδότηση από ιδιωτικό φορέα, Pipeline for Development and Commercialization of Biological Nitrification Inhibitors to mitigate GHG Emissions from Cultivated Soils. Διάρκεια: 2022 – 2024, (Συμμετέχουσα: Παπαδοπούλου Ε.)
  4. ΓΓΕΚ-ΕΛΙΔΕΚ, FRIDA- FRom Inhibition to aDAptation: Exploring the interplay between nitrification inhibitors and the soil microbiome towards a sustainable agriculture. Διάρκεια: 2022-2025, (Συντονίστρια Dr Chiara Perruchon, Επικεφαλής ΦΥ: Παπαδοπούλου Ε.). https://frida.env.uth.gr/
  5. EU- HORIZON-WIDERA-2021-ACCESS-03 (Twinning), ACTIONr- Research Action Network for Reducing Reactive Nitrogen Losses from Agricultural Ecosystems. Διάρκεια: 2022 – 2025, (Συμμετέχουσα: Παπαδοπούλου Ε.). https://www.actionr.eu/
  6. ΓΓΕΚ-ΕΛΙΔΕΚ, REASSESS-REvolutionizing the Assessment of the toxicity of pesticides on Soil microorganisms: from Single species tests to EcoSystem approacheS. Διάρκεια: 2022-2025, (Συμμετέχουσα: Παπαδοπούλου Ε.). https://reassess.bio.uth.gr/
  7. EU, MSCA – ITN – EID – H2020, ARISTO- The European Industry – Academia Network for RevIsing and Advancing the Assessment of the Soil Microbial TOxicity of Pesticides. Διάρκεια: 2020-2023, (Συμμετέχουσα: Παπαδοπούλου Ε.). https://aristo.bio.uth.gr/

Χρηματοδοτήσεις